Về công trình gác chuông chùa Thiên Trù, các cơ quan chức năng khẳng định làm đúng trình tự thủ tục như quy định tại Luật Di sản, tuy nhiên trong quá trình thi công không thực hiện đúng thoả thuận. Trước mắt, Sở yêu cầu cạo toàn bộ màu sơn công nghiệp ở các cột gỗ, trả lại màu gỗ tự nhiên. Đá chân tảng hiện nay cũng cần bổ sung hoa văn hoa sen đúng truyền thống. Ngoài ra, Sở yêu cầu UBND huyện Mỹ Đức thành lập ngay hội đồng đánh giá các cấu kiện hạ giải của gác chuông để đánh giá, phân loại để bảo quản, hoặc tiêu huỷ theo quy trình.